Столь совершенного и универсального десантного корабля не было ни у одного флота мира. Но шесть лет, до начала «большой войны» на Тихом океане, Синсю-Мару оставался единственным. Он принял участие в морском десанте на Филиппины, затем в десантах в голландской Ост-Индии, эта десантная операция и стала последней для него. Во время высадки десанта на остров Яву Синсю-мару среди других транспортов стал свидетелем боя корабельного соединения прикрытия десанта с отрядом крейсеров союзников. Японские тяжелые крейсера выпустили по союзникам с большого расстояния около ста мощных дальнобойных торпед. Одна из них сыграла с японцами злую шутку. Пройдя около 30 км, она случайно попала в Синсю-мару, и тот немедленно утонул. Через год Синсю мару поднят, отремонтирован и введён в строй, но время активных действий на просторах Тихого океана для японцев уже закончилось