Микаэл Аджапахян (имя при рождении — Геворг Арташесович Аджапахян) родился в Гюмри. После рукоположения в сан принят имя Микаэл, в память о священнике-мученике с тем же именем, погибшем во время Аданской резни 1909 года Исторический род Аджапахянов: • Его семья принадлежит к известному роду, представители которого на протяжении более 135 лет занимали престол Киликийского Католикосата в Сисе (в исторической Киликии, ныне Турция) • Среди выдающихся представителей рода: Католикос Гукас (1731–1737) Католикос Микаэл I (1737–1758) Католикос Габриэл, Ефрем I и II, Теодорос, Киракос I и II — все поочередно руководили Католикосатом в XVIII–XIX вв. • В 1939 году архиепископ Хад Аджапахян, духовный лидер рода, руководил вынужденным переселением армян Александреттского санджака (передавался Турции) от лица ААЦ