Одна из прекраснейших вещей в биологии, на мой взгляд, это разнообразие того, как может функционировать жизнь. Вирусы с выбивающимися из всех рамок механизмами репликации, бактерии, достающие протоны из радиолиза воды под действием урановых руд, ю нейм ит. Мы изучаем все многообразие жизни на планете, и не устаем поражаться каким-то ярким исключениям. Метаболизм, особенно вторичный, бывает очень разнообразен, да. Но вопрос, который заставил меня сейчас задуматься и начать писать пост — а насколько разнообразен белковый хардвэр? В смысле, роскошества разнообразного метаболизма получились из дупликаций и неоспециализаций генов одних и тех же групп ферментов, и как будто все сводится к тому, чтобы комбинировать, перетасовывать и оптимизировать буквально пару десятков понятных белковых доменов и структур. И даже неродственные друг другу эволюционно белки все равно используют одни и те же домены — типа там укладки Россмана для связывания нуклеотидов, или лейцин-богатые повторы для связывания крупных лигандов в рецепторах распознавания паттерна. Есть такое ощущение, что разнообразие белковых укладок, которое мы можем найти в природе — даже в самых непонятных организмах — может оказаться сильно меньшим чем то, что там теоретически предсказано в альфафолде. Аналогия такая, я пока не понимаю, нравится она мне или нет, но метаболизм это софтвер, а белки хардвер. С одной стороны, прикольно, что используя всего лишь небольшую часть всех возможных укладок, получилось создать такое огромное биоразнообразие. С другой, как-то хочется не переставать удивляться в том числе новым функциональным укладкам у каких-нибудь невероятных организмов. Это, кстати, очень умозрительные заключения, я давно не обновлял свои знания по теме эволюции укладок.