🌍🧬 Как агрогеномика меняет представление о «естественных» экосистемах Долгое время экосистемы воспринимались как «естественные» и устойчивые сами по себе. Но развитие агрогеномики и метагеномики показало: даже самые «дикие» системы — это динамичные сети генов, микроорганизмов и взаимодействий, которые можно измерять, моделировать и частично управлять. ⬜️ Экосистема — это не виды, а гены Современные методы (метагеномика) позволяют анализировать ДНК всех организмов в почве или на растении сразу. ⚪️ Выяснилось, что в одном грамме почвы может быть до 10⁹–10¹⁰ микробных клеток, а их генетическое разнообразие огромно. ▶️ Эти сообщества управляют круговоротом азота, углерода и фосфора — то есть фактически определяют рост растений. ▶️ Экосистема — это не просто «набор видов», а функциональная сеть генов и метаболических процессов. ⬜️ «Естественные» системы уже управляются растениями Растения активно формируют своё окружение: ⚪️ выделяют корневые экссудаты, ⚪️ отбирают нужные микробы, ⚪️ меняют состав почвенного микробиома. ▶️ В итоге каждый генотип растения создаёт свою микробную экосистему, отличающуюся от других. ▶️ Это означает, что даже без вмешательства человека экосистемы уже являются «сконструированными» биологией самих растений. ⬜️ Где здесь ИИ Сейчас ИИ начинают использовать для анализа таких систем: ⚪️ предсказания признаков растений по микробиому, ⚪️ поиска связей между генами и функциями экосистемы, ⚪️ моделирования «сборки» микробных сообществ. ▶️ Исследования показывают, что точность прогнозов резко растёт, если учитывать и микробиом, и среду одновременно — это подтверждает, что экосистема работает как единое целое. @agrogenome #ИИ