Kardymonchik Channel

23andMe подала на банкротство в США, рассказывает сегодня русский Forbes . Вот я очень сильно хочу, чтобы инвестиции в генетические компании продолжались и увеличивались. Но сейчас наступает время, когда инвесторы начинают задумываться о пользе и достоверности тестов из группы «развлекательной» генетики и больше оценивают компании, ведущие разработки вакцин, занимающиеся дизайном белков, подбором персонализированной терапии. Отдельно успехом здесь пользуются стартапы, использующие либо геномное ...

Семейство языковых моделей ДНК GENA-LM наконец-то опубликовали в рецензируемом журнале. Пока я временно выпала из работы, выкармливая свою двойню, команда добила статью по GENA-LM до публикации. Это был сложный путь. Сразу мы год общались с ревьюерами и редактором Nature Methods, ответив на все вопросы и добавив запрошенные дополнительно задачи. Нас отклонили субъективным решением редактора. И вскоре стало понятно почему: вышла статья с моделью от наших конкурентов, которая так же не отличается ...

James Watson , нобелевский лауреат, открывший с коллегами двойную спираль ДНК, умер 6 ноября в 97 лет. Очень много разного про него было и сказано, и написано последние 15 лет. В том числе под сомнение был поставлен его вклад в открытие спирали, продажа самой медали, ее возврат обратно (например тут кратко собрали отдельные любопытные этапы). Но это точно была долгая, яркая и интересная жизнь от начала и до конца. Nature news RIP

Маша Синдеева, которая большая молодец, написала хорошую статью на Хабр про дизайн белков и наш новый инструмент для него. Кажется, что достаточно просто и понятно. https://habr.com/ru/companies/airi/articles/933238/ «Почувствуй себя рибосомой» вместе с Машей :)

Дошли руки до AlphaGenome - модель от Google, способная по последовательностям ДНК в 1 млн "букв" делать предсказания среди 11 модальностей, включающих экспрессию генов, элементы сплайсинга, состояние хроматина и карты хроматиновых контактов. Плюсы: - очень простой и понятный тьюториал. Для коллег, занимающихся образованием, очень рекоммендую попробовать готовые блокноты. - для запуска ничего не надо, кроме API ключа (нет никакой проблемы получить) - отдельные треки предсказывает очень хорошо Ми...

«Крепитесь люди, скоро лето!» и не просто лето, а уже четвертная школа «Лето с AIRI». Тысячи заявок на участие каждый год, 10 дней погружения в ИИ в формате 24/7, ведущие спикеры из самых популярных областей, работа над своим проектом. И все это в этом году в Томске! Советую не тормозить и осознанно поработать над заявкой. До 29 апреля еще есть время. Без должной мотивации вряд ли получится пройти отбор. Все подробности в посте Института.

Друзья, у меня постоянно спрашивают не знаю я того или иного профиля специалиста, подходящего под конкретные проекты в разных странах. Плюс в Quantori тоже регулярно появляются позиции под проекты. Если вы ищете работу биоинформатиком/датасайнтистом/датаинженером для работы с биологическими/лабораторными данными - присылайте ваши CV на bioinfo.srb@gmail.com . Ну а сегодня на проект в крупную известную западную фармкомпанию ищут джуна-мидла, для автоматизации экспериментов через лабсистему и кури...

Вы заметили с какой скоростью мы живем? Лидерство в ИИ сменяется за месяцы и как следствие - сложность долгосрочного планирования Скорость как новая константа: почему технологическое лидерство больше не измеряется годами. Сегодня произошло нечто примечательное: компания, существующая всего год, представила ИИ-модель, превзошедшую разработки организаций с десятилетней историей. xAI не просто догнала, а во многих аспектах превзошла OpenAI и Google. Это событие заставляет нас переосмыслить наше пон...

Люблю когда разработанные модели реально используются в работе с клиническими данными. Последни полгода читала заключения по экзомам и геномам из разных клиник и приятно отметила (не удивилась), что DeepVariant в целом достойно занял свое место в биоинформатических пайплайнах (не прошло и 10 лет). А тут на днях опубликовали DeepSomatic - коллер для опухолевых вариантов под любую платформу (но на длинных ридах лучше работает). Здорово, что тут скажешь. И статья хорошая. (если кто про DeepVariant ...

🧬 Anthropic вчера рассказал, что прикрутил к Claude несколько конекторов для более эффективной работы в Life Sciences добавил агентов для нескольких задач. Утверждается, что Claude лучше понимает лабораторные протоколы, чем человек (их создавший). Теперь подключается к Benchling, BioRender, PubMed и даже 10x Genomics. Можно буквально написать: «сделай QC по scRNA-seq» — и он сделает. Якобы смоделирует молекулы с заданными свойствами (врут скорее всего, либо что-то очень простое). А вот что поле...